生物发酵罐的温度对整个发酵过程的各个方面都是有害的。会损害各种酶的速度。改变细菌代谢产物的生产方向。有害微生物菌株的代谢控制系统。除了这种立竿见影的危害，温度还会危害发酵液的理化性质，如发酵液的粘度、培养基和氧气在发酵液中的溶解度和传递速度、一些培养底物的溶解消化吸收速度等，从而危及发酵动力学模型和微生物生产产品的特性。

　　适合生物发酵罐的发酵温度是既适合细菌生长发育又适合代谢产物生成的温度，随着疫苗、培养基成分、成型标准以及细菌生长发育的不同而变化。理论上，整个发酵过程不应只选择一个成型温度。应该是基于发酵的不同环节，选择不同的成型温度。

　　但是在具体的生产中，由于发酵液的体积很大，升程温度很难，所以在整个发酵过程中，通常选择更合适的成型温度，使产品收率高，或者在非常可能的标准下进行适度的调整。在生长发育过程中，要选择适合生长发育的温度，在产品代谢过程中，要选择适合生产制造的温度。

　　必须控制发酵温度。首先，发酵温度必须精确测量。发酵温度可通过温度计或自动记录仪检查，并根据发酵罐筒夹或环形管中的冷水、开水或蒸汽进行调节。在工业生产中，通常使用的大型发酵罐在整个发酵过程中通常不需要加热，因为发酵过程中会释放大量的发酵热量，在这种条件下必须进行多方面的制冷，使用自动控制系统或手动调节闸阀，将冷却循环水引入夹头或环形管，根据热交换器来减温，维持控温发酵。